生命科学学院伊成器研讨组在《天然·化学生物学
来源:证实网 发表于2019-07-28 06:48:12 编辑:乾隆
摘要: 2019年2月10日,北京大学生命科学学院伊成器研讨组在《天然化学生物学》(Nature Chemical Biology)杂志在线宣布题为Transcriptome-wide mapping reveals reversible and d

2019年2月10日,北京大学生命科学学院伊成器研讨组在《天然·化学生物学》(Nature Chemical Biology)杂志在线宣布题为“Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N1-methyladenosine methylome”的研讨论文(DOI: 10.1038/NCHEMBIO.2040)。文章初次报导了人类mRNA中一种新式的转录后润饰,即1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenosine,m1A);并开发了测序新技能“m1A-ID-seq”,完成了全转录组水平上m1A这一可逆RNA润饰的谱图判定。同一天,来自美国芝加哥大学何川教授和以色列Gideon Rechavi教授的协作研讨在《天然》杂志一起报导了真核细胞中m1A润饰的谱图,并进一步发现m1A润饰可以促进蛋白质的翻译进程(Nature, doi:10.1038/nature16998)。这些发现扩展了mRNA中的润饰品种,为“RNA表观遗传学”范畴供给了簇新的研讨方向。

转录后润饰对生命体至关重要。m1A RNA润饰广泛存在于各种非编码RNA中;但是,信使RNA(messenger RNA,mRNA)上是否存在m1A并不清楚。为了研讨人细胞转录组中的m1A润饰,伊成器课题组首要使用高分辩质谱对mRNA中的m1A润饰进行定量,发现其广泛存在于各种细胞系中。该研讨继而经过化学生物学、高通量测序等手法,开展了“m1A-ID-seq” ——一种结合抗体富集和特异性酶促反响的m1A测序新技能。使用这一技能,该研讨成功完成了人细胞系全转录组水平的高分辩率m1A检测,判定出901个含有m1A润饰的转录本,而且发现m1A出现激烈的5’非转录区别布特异性。这一散布规则与m6A(真核细胞mRNA中最广泛的甲基化润饰)天壤之别,后者首要会集在mRNA的最终一个外显子上,而且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个进程进行调控。该研讨进一步判定了m1A润饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个效果位点。因而,该研讨不光提醒了m1A的广泛存在、制作了转录组中m1A RNA润饰的谱图,也为m1A润饰参加基因表达调控的研讨供给了重要东西。

北京大学生命科学学院博士生李笑雨(PTN-BBS联合培育项目)、北大-清华生命科学联合中心博士生熊旭深是这篇论文的并列第一作者,生命科学学院伊成器研讨员是该论文的通讯作者。该研讨得到了国家天然科学基金、科技部973方案和北大-清华生命科学联合中心的赞助。

m1A-ID-seq制作人全转录组m1A RNA润饰谱图

(a)m1A-ID-seq流程图;(b)HEK293T细胞系全转录组水平m1A润饰散布出现出5‘UTR特异性;(c)ALKBH3是mRNA上m1A的去甲基化酶。

修改:舍予

 

生命科学学院伊成器研讨组在《天然·化学生物学》报导新式甲基化腺嘌呤RNA润饰谱图

 

生命科学学院伊成器研讨组在《天然·化学生物学》报导新式甲基化腺嘌呤RNA润饰谱图

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